Кузьмин Дмитрий Александрович | Структура и сотрудники СФУ

Кузьмин Дмитрий Александрович

Кузьмин Дмитрий Александрович
e-mail: dkuzmin [at] sfu-kras [dot] ru
телефон: +7 (391) 249-74-25
адрес: ул. Киренского, 26, к. 1, ауд. 4-06
анкета на другом сайте: ikit.sfu-kras.ru/employees/88
степень: кандидат технических наук
звание: доцент

Место работы

Диссертации

  • Исследование и разработка методов выполнения функционально-параллельных программ, (кандидат технических наук, 2004).

Образование

  • Красноярский политехнический институт, вычислительные машины, комплексы, системы и сети, 1991 г.

Научные направления

  • технологии и программное обеспечение распределенных и высокопроизводительных вычислительных систем;
  • биоинформатика.

Преподаваемые дисциплины

  • Системное программное обеспечение;
  • Гибридные вычислительные системы;
  • Организация и управление высокопроизводительными вычислительными комплексами;
  • Введение в суперкомпьютерные технологии (аспирантура).

Повышение квалификации

  • «Разработка электронных курсов в системе LMS Moodle», 72 часа, СФУ, 2018 г.;
  • «Подготовка к Кембриджским экзаменам - FCE», 240 часов, СФУ, 2017 г.;
  • «Клиническая биоинформатика», 18 часов, СФУ, 2017 г.;
  • English for Scientists, 144 часов, СФУ, 2016 г.;
  • «Модели и технологии интегрированного обучения», ТГУ, 2016 г.;
  • Учебно–методический семинар «ИТ-профессионал 2020», EMC Academic Alliance, 2015 г.;
  • Стажировка по программе «Configuration and Management of Networks», 40 часов, c 9.04.2012 — 20.04.2012 в университете Нова, Лиссабон, Португалия в рамках участия в проекте ТЕМПУС «159386-TEMPUS-1-2009-1-DE-TEMPUS-JPCR » «Модернизация магистерской программы «Сети и телекоммуникации» (MoNetCom)», 2012 г.
  • «Современные информационные технологии», 72 часов, Новосибирский государственный университет, 2011 г.;
  • «Основы параллельного программирования», СФУ, 2010 г.

Стаж работы

  • общий — 30 лет
  • по специальности — 30 лет

Публикации

  1. Annotation of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Nuclear Genome—One of the Most Cold-Resistant Tree Species in the Only Deciduous GENUS in Pinaceae [статья из журнала]
    2022, Plants
  2. ANNOTATION OF SIBERIAN LARCH REFERENCE GENOME, THE ONLY SEASONAL SENESCENCE GENUS IN PINACEAE : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Bondar E. I., Feranchuk S. I., Miroshnikova K. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Oreshkova N. V., Krutovsky K. V.
    2022, Высокопроизводительное секвенирование в геномике (HSG-2022)
  3. De Novo Transcriptome Assembly and Annotation of a New Plant Pathogenic Corinectria sp. Strain in Siberia : научное издание [статья из журнала]
    Biriukov V. V., Pavlov I. N., Litovka Yu. A., Oreshkova N. V., Sharov V. V., Simonov E. P., Kuzmin D. A., Krutovsky K. V.
    2022, Микология и фитопатология
  4. Annotation of Siberian larch genome draft assembly : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Bondar E. I., Feranchuk S. I., Birukhov V. V., Kuzmin D. A., Sharov V. V., Oreshkova N. V., Krutovsky K. V.
    2021, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology
  5. Repetitive elements in the genome of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Miroshnikova K. A., Biriukov V. V., Kuzmin D. A., Sadovsky M. G., Bondar E. I., Putintseva Y. A., Krutovsky Konstantin V., Akulova V. S., Sharov V. V., Oreshkova N. V.
    2020, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/SYSTEMS BIOLOGY (BGRS/SB-2020)
  6. Параллельная программа для вычисления функций роста бернсайдовых двупорожденных групп на GPU : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    2020
  7. Программа для автоматизации деятельности сервисного центра : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Кузьмин Дмитрий Александрович, Назарова Софья Александровна, Эмилбек кызы Земфира, Макуха Любовь Витальевна, Сидоров Анатолий Юрьевич, Гриул Артем Игоревич
    2020
  8. LIBRARY OF MATHEMATICAL FUNCTIONS WITH PARALLELISM AT THE OPERATIONAL LEVEL IN THE PYTHAGOR LANGUAGE : научное издание [статья из журнала]
    Udalova J. V., Kuzmin D. A., Кузнецов А. А. (рец.)
    2019, Сибирский журнал науки и технологий
  9. Assembling of the Siberian larch mitochondrial genome using long nucleotide sequence reads, the largest currently known mitogenome : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    2019, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology (PlantGen2019)
  10. Development of Nuclear Microsatellite Markers with Long (Tri-, Tetra-, Penta-, and Hexanucleotide) Motifs for Three Larch Species Based on the de novo Whole Genome Sequencing of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) [статья из журнала]
    2019, RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS
Показать все публикации
  1. Разработка ядерных микросателлитных маркеров с длинными (трех-, четырех-, пяти- и шестинуклеотидными) мотивами для трех видов лиственницы на основе полногеномного de novo секвенирования лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) : научное издание [статья из журнала]
    2019, Генетика
  2. Программа фильтрации избыточных последовательностей геномов в формате FASTA : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    2018
  3. Программный комплекс мониторинга изменений в файловой системе под управлением операционной системы Linux : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    2018
  4. Программный комплекс для объединения результатов поиска SNP в геномах : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    2018
  5. О ЗАДАЧЕ ИМИТАЦИОННОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ РАБОТЫ СЕКВЕНАТОРА NGS : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Шаров В. В., Кобец В. А., Кузьмин Д. А., Ходос Г. А., Садовский М. Г.
    2018, Нейроинформатика, её приложения и анализ данных
  6. Программа симуляции геномных данных с повторами : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Цыбин Александр Николаевич, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2017
  7. Комплекс предобработки ридов NGS : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    2017
  8. СБОРКА И АННОТИРОВАНИЕ ГЕНОМА ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    2017, Высокопроизводительное секвенирование в геномике
  9. De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus : научное издание [статья из журнала]
    Moskalev A. A., Kudryavtseva A. V., Graphodatsky A. S., Beklemisheva V. R., Serdyukova N. A., Krutovsky K. V., Sharov V. V., Kulakovskiy I. V., Lando A. S., Kasianov A. S., Kuzmin D. A., Putintseva Y. A., Feranchuk S. I., Shaposhnikov M. V., Fraifeld V. E., Toren D., Snezhkina A. V., Sitnik V. V.
    2017, BMC Evolutionary Biology
  10. РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ : научное издание [статья из журнала]
    2017, Генетика
  11. Development of Microsatellite Genetic Markers in Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Based on the de novo Whole Genome Sequencing : научное издание [статья из журнала]
    2017, RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS
  12. ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ АННОТАЦИЯ ГЕНОМА ЛИСТВЕННИЦЫ КАК ПОДХОД К ПРОЯСНЕНИЮ МЕХАНИЗМОВ ФОРМИРОВАНИЯ ВАЖНЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ПРИЗНАКОВ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    2017, Сохранение лесных генетических ресурсов
  13. Программа для индексирования геномных последовательностей большого размера методом "FM-index" на графических ускорителях : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    2016
  14. STUDY OF ARMILLARIA BOREALIS PATHOGENICITY BY THE COMPARATIVE WHOLE GENOME SEQUENCING : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    2016, The tenth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\systems biology
  15. SEQUENCING OF CONIFER GENOMES USING NGS : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    2016, The tenth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\systems biology
  16. Разработка микросателлитных маркеров сосны кедровой сибирской (italicPinus sibirica/italic Du Tour) по результатам полногеномного italicde novo/italic секвенирования : научное издание [статья из журнала]
    Белоконь М. М., Кузьмин Д. А., Крутовский К. В., Политов Д. В., Мудрик Е. А., Полякова Т. А., Шатохина А. В., Белоконь Ю. С., Орешкова Н. В., Путинцева Ю. А., Шаров В. В.
    2016, Генетика
  17. ПАРАЛЛЕЛЬНЫЙ АЛГОРИТМ ФИЛЬТРАЦИИ ПОВТОРОВ В ДАННЫХ NGS ILLUMINA : научное издание [статья из журнала]
    Цыбин Александр Николаевич, Шаров Вадим Витальевич, Путинцева Юлия Андреевна, Феранчук Сергей Ильич, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2016, Доклады Академии наук высшей школы Российской Федерации
  18. ИССЛЕДОВАНИЕ МЕТОДОВ ОЦЕНКИ ЭФФЕКТИВНОСТИ ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫХ СИСТЕМ НА ОСНОВЕ ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ МОДЕЛЕЙ [статья из журнала]
    2016, Вестник Сибирского государственного аэрокосмического университета им. академика М.Ф. Решетнева
  19. Development of Microsatellite Genetic Markers in Siberian Stone Pine (Pinus sibirica Du Tour) Based on the de novo Whole Genome Sequencing [статья из журнала]
    Belokon M. M., Politov D. V., Mudrik E. A., Polyakova T. A., Shatokhina A. V., Belokon Yu. S., Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Krutovsky K. V.
    2016, RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS
  20. Программный комплекс для определения размера библиотек (insert size) парных ридов NGS Illumina : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    2015
  21. Программный комплекс по подготовке ридов NGS Illumina к ассемблированию : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    2015
  22. Программный комплекс фильтрации повторяющихся последовательностей (рипитов) в ридах NGS Illumina : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Цыбин Александр Николаевич, Кузьмин Дмитрий Александрович, Феранчук Сергей Ильич, Путинцева Юлия Андреевна
    2015
  23. CHALLENGES OF ASSEMBLING HUGE CONIFER GENOMES : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    2015, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology
  24. THE WHOLE DE NOVO GENOME SEQUENCING AND ASSEMBLY OF SIBERIAN LARCH (LARIX SIBIRICA LEDEB.) AND SIBERIAN PINE (PINUS SIBIRICA DU TOUR.) : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    2015, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology
  25. DE NOVO SEQUENCING OF CONIFER MEGAGENOMES : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Krutovsky K. V., Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Kuzmin D. A., Sharov V. V., Biryukov V. V., Makolov S. V., Deych K. O., Bondar E. I., Ushakova O. A., Ibe A. A., Shilkina E. A.
    2015, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology
  26. СИСТЕМА КЛИЕНТСКОГО ДОСТУПА К РЕСУРСАМ ОБЛАЧНОЙ РЕНДЕРФЕРМЫ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    2014, СОВРЕМЕННОЕ СОСТОЯНИЕ И ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ ТЕХНИЧЕСКИХ НАУК
  27. МОДЕЛИРОВАНИЕ СИСТЕМЫ ПЛАНИРОВАНИЯ РАСПРЕДЕЛЕННОГО ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО ВЫЧИСЛИТЕЛЬНОГО КОМПЛЕКСА [статья из журнала]
    2014, Доклады Академии наук высшей школы Российской Федерации
  28. ВИЗУАЛИЗАЦИЯ ТРЕХМЕРНЫХ МОДЕЛЕЙ НА СУПЕРКОМЬЮТЕРНЫХ РЕСУРСАХ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    2012, Научный сервис в сети Интернет: поиск новых решений
  29. СОЗДАНИЕ GRID-СЕРВИСА ДЛЯ ПРЕДОСТАВЛЕНИЯ ДОСТУПА К СУПЕРКОМПЬЮТЕРУ СФУ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    2011, Научный сервис в сети Интернет: экзафлопсное будущее
  30. ОРГАНИЗАЦИЯ GRID-ИНФРАСТРУКТУРЫ ДЛЯ ПРЕДОСТАВЛЕНИЯ СЕРВИСОВ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНЫХ ВЫЧИСЛЕНИЙ НАУКОЕМКИМ ПРЕДПРИЯТИЯМ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    2011, Научный сервис в сети Интернет: экзафлопсное будущее
  31. СОЗДАНИЕ КЛАСТЕРНОГО ГРИДА НА БАЗЕ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНЫХ РЕСУРСОВ СФУ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    2010, Научный сервис в сети Интернет: суперкомпьютерные центры и задачи
  32. Компьютерные алгоритмы теоретико-множественного анализа сложных алгебраических систем : монография [монография]
    Кузнецов Александр Алексеевич, Кузьмин Дмитрий Александрович, Лыткина Дарья Викторовна, Тухватуллина Ляйсан Ринатовна, Филиппов К. А.
    2009
  33. Исследование и разработка методов выполнения функционально-параллельных программ : диссертация на соискание ученой степени кандидата технических наук [диссертация]
    2004
  34. Исследование и разработка методов выполнения функционально-параллельных программ : автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата технических наук [автореферат диссертации]
    2004

Список публикаций выше сформирован в автоматическом режиме. Сообщите, если заметили неточности.

Вы можете отметить интересные фрагменты текста, которые будут доступны по уникальной ссылке в адресной строке браузера.